慧通綜合報道：

研究成果相繼在《Nature》、《Science》、《Nature Genetcis》、《Nature Biotechnology》、《Plant Cell》、《Proc Natl Acad Sci USA》、《Elife》、《Nucleic Acids Res》等國際著名學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表；2012—2015年，共計發(fā)表研究論文431篇，SCI影響因子9以上的88篇；申請發(fā)明專利107項，新獲得專利授權(quán)102項；獲批兩個軟件著作權(quán)；獲得國家自然科學(xué)二等獎1項；培養(yǎng)博士研究生227人，碩士研究生192人……

這是863計劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域“水稻等主要農(nóng)作物功能基因組”所取得的成績。

2014年《國家中長期科學(xué)和技術(shù)發(fā)展規(guī)劃綱要（2006—2020年）實施情況中期評估》“農(nóng)業(yè)領(lǐng)域?qū)ｎ}評估報告”中，“水稻等主要農(nóng)作物功能基因組學(xué)”的研究成果被列為農(nóng)業(yè)領(lǐng)域重大標(biāo)志性成果之首。

通過項目的實施，最終將建立一系列新型高通量功能基因組研究平臺，分離克隆一批擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的功能基因，全面揭示控制主要農(nóng)作物重要農(nóng)藝性狀的生物學(xué)機(jī)制，為農(nóng)作物的遺傳改良提供基因資源和分子操作藍(lán)本，極大地提升作物遺傳改良研究的水平，全面推動農(nóng)業(yè)科學(xué)的發(fā)展。

項目首席專家華中農(nóng)業(yè)大學(xué)張啟發(fā)教授介紹，我國是世界上較早啟動作物功能基因組研究計劃的國家，項目針對作物生產(chǎn)中“少投入、多產(chǎn)出、保護(hù)環(huán)境”的作物育種目標(biāo)，通過解析水稻、玉米、小麥這三大農(nóng)作物功能基因組，在水稻、玉米和小麥資源、信息和生物技術(shù)平臺的構(gòu)建完善以及調(diào)控產(chǎn)量、品質(zhì)、抗逆、養(yǎng)分水分高效吸收利用重要農(nóng)藝性狀功能基因和調(diào)控因子的克隆，基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)解析等領(lǐng)域取得了一系列重要進(jìn)展。研究成果相繼發(fā)表在Nature、Science等國際頂尖學(xué)術(shù)期刊物上，體現(xiàn)了我國作物功能基因組研究在國際上的優(yōu)勢地位和領(lǐng)先水平。

目前，我國水稻功能基因組研究居世界領(lǐng)先行列?？寺×水a(chǎn)量性狀基因GS3、GW2、GW8、GS5、Ghd7，獨角金內(nèi)酯途徑的關(guān)鍵負(fù)調(diào)節(jié)因子D53，秈粳廣親和基因S5，光敏不育基因pms3，抗旱、抗鹽堿基因DWA1、SIT1，耐寒基因COLD1，抗病蟲基因STV11、Xa26、xa13、xa25、Bph14、Bph3，氮利用基因DEP1，稻米品質(zhì)基因Chalk5和OsAAP6等。這些基因的克隆不僅代表了該領(lǐng)域國際研究的前沿進(jìn)展，在育種中表現(xiàn)出重要應(yīng)用前景。據(jù)統(tǒng)計，2011—2014年間全世界在影響因子（IF）大于9的刊物上共發(fā)表水稻論文328篇，其中來自于中國大陸的論文140篇，占43%。

水稻功能基因組研制水稻全基因組育種芯片，建立我國第一套作物全基因組選擇育種技術(shù)平臺，填補(bǔ)國內(nèi)空白。該項目研發(fā)的三個不同密度的具有我國自主知識產(chǎn)權(quán)的水稻全基因組育種芯片，為全球首創(chuàng)，已經(jīng)被證明能成功地應(yīng)用于水稻雜交群體分析、品種鑒定、定向改良以及分子設(shè)計育種實踐等，在水稻遺傳研究及育種應(yīng)用中具有非常好的應(yīng)用前景。截至目前，已為全國二十余家單位提供全基因組育種芯片及分子標(biāo)記檢測服務(wù)。

小麥和玉米功能基因組發(fā)展迅速，在多個領(lǐng)域占據(jù)領(lǐng)先優(yōu)勢。小麥構(gòu)建了世界上第一個小麥D基因組的框架圖。該框架圖的構(gòu)建結(jié)束了小麥沒有全基因組組裝序列的歷史，對小麥基因組研究具有重要的意義。玉米利用全基因組關(guān)聯(lián)分析大規(guī)模地、系統(tǒng)性地鑒定影響含油量和脂肪酸組分的基因位點，提出“微效多基因的累加是人工選擇高油玉米成因”的學(xué)術(shù)觀點，從基因組水平上對作物輪回選擇獲得增益的育種學(xué)理論進(jìn)行了系統(tǒng)的遺傳剖析。

同時，張啟發(fā)建議，部分產(chǎn)量、品質(zhì)、抗逆性狀基因克隆方面所取得的成果尚是初步的，距離系統(tǒng)解析性狀形成的分子機(jī)理尚有很大差距；希望能集中優(yōu)勢力量，針對重要農(nóng)藝性狀形成的分子機(jī)理進(jìn)行深入研究，全面解析這些重要農(nóng)藝性狀基因的生物學(xué)功能及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，最終實現(xiàn)對主要農(nóng)作物重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行有效的遺傳調(diào)控，解決生產(chǎn)育種的實際問題；小麥基因組比較復(fù)雜，由于小麥基因組的龐大和復(fù)雜，在測序和序列分析時對數(shù)據(jù)分析的硬件和平臺要求特別高；數(shù)據(jù)的挖掘和分析需要完善的硬件條件和生物信息團(tuán)隊。

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